人民網(wǎng)長沙9月15日電 一張全基因組育種芯片上均勻分布超12萬個(gè)基因位點(diǎn)，平均檢出率達(dá)99.5%，重復(fù)樣品檢測平均一致性達(dá)99.4%，盲樣檢測性能良好，達(dá)到國際先進(jìn)水平……近日，中國荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片發(fā)布，標(biāo)志著我國荷斯坦牛中高密度育種芯片自主設(shè)計(jì)開發(fā)取得重要突破。

　　據(jù)悉，荷斯坦牛是當(dāng)前世界奶牛的主要品種，作為單胎大型動(dòng)物，選擇出優(yōu)秀種公牛是奶牛育種的核心工作。目前，國際上已進(jìn)入奶牛基因組選擇育種時(shí)代，使用中高密度育種芯片，能使種公牛培育周期由約6年縮短至約2年，育種效率顯著提升。

　　“十四五”國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目首席科學(xué)家、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)教授孫東曉就表示，我國近年來加速構(gòu)建和優(yōu)化奶牛基因組選擇育種技術(shù)平臺(tái)，但過去完全依賴國外育種芯片，國內(nèi)種牛檢測樣品需要送到國外實(shí)驗(yàn)室檢測，存在技術(shù)“卡點(diǎn)”及生物信息安全風(fēng)險(xiǎn)。

　　在奶牛基因組選擇育種時(shí)代，高通量SNP檢測技術(shù)平臺(tái)堪稱育種“芯片”，為實(shí)現(xiàn)我國國產(chǎn)奶牛育種芯片零的突破，2020年8月，首農(nóng)食品集團(tuán)北京奶牛中心、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、華智生物技術(shù)有限公司啟動(dòng)奶牛育種芯片自主設(shè)計(jì)開發(fā)聯(lián)合攻關(guān)。

　　奶牛育種芯片自主開發(fā)經(jīng)歷了一系列科學(xué)、嚴(yán)謹(jǐn)?shù)脑O(shè)計(jì)、驗(yàn)證和反復(fù)論證，攻關(guān)團(tuán)隊(duì)基于中國荷斯坦牛群體挖掘驗(yàn)證了一大批效應(yīng)顯著的基因突變位點(diǎn)，最終自主設(shè)計(jì)了涵蓋超12萬個(gè)位點(diǎn)（即126K）的育種芯片，該款芯片不僅兼容現(xiàn)有參考群和多款商業(yè)化芯片位點(diǎn)信息，還提高了芯片數(shù)據(jù)填充準(zhǔn)確性及奶?；蚪M遺傳評(píng)估準(zhǔn)確性。

　　奶牛126K液相基因組育種芯片通過了專家論證，專家組認(rèn)為芯片設(shè)計(jì)科學(xué)合理，經(jīng)過檢測驗(yàn)證、盲樣復(fù)檢、多平臺(tái)對(duì)比、填充效果驗(yàn)證等多輪測試，驗(yàn)證程序完善。參照國際同類產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)，達(dá)到產(chǎn)業(yè)化推廣應(yīng)用水平，可用于荷斯坦?；蚪M選擇參考群體的構(gòu)建及種牛評(píng)價(jià)。

　　“這是我國荷斯坦牛育種領(lǐng)域首款中高密度育種芯片，對(duì)提升我國種公牛自主培育能力和水平，進(jìn)一步完善奶牛種質(zhì)自主評(píng)價(jià)體系具有重要意義。”中國奶業(yè)協(xié)會(huì)副秘書長陳紹祜說。

　　中國奶業(yè)協(xié)會(huì)育種專業(yè)委員會(huì)主任麻柱說，奶牛育種自主創(chuàng)新聯(lián)盟將率先用上這款芯片，助力保障我國奶牛自主選育體系穩(wěn)定運(yùn)行，維護(hù)生物信息安全，并將進(jìn)一步提升我國奶牛自主選育能力，助力奶牛種業(yè)振興。（林洛頫、龍宇)