◎本報記者 付麗麗
“輸入一個病人,比如一個胃癌病人疾病相關的多組學數(shù)據(jù),AIGP平臺即能夠分析這些數(shù)據(jù),找到針對這個胃癌病人的靶點,根據(jù)這個靶點生成一個抗體甚至一系列多樣性的蛋白質。最后,一鍵式生成的蛋白質還可以回到自動實驗室里進行合成及功能驗證。”3月31日,百圖生科(北京)智能技術有限公司(以下簡稱百圖生科)CTO宋樂向科技日報記者介紹。百圖生科基于生命科學大模型驅動的AIGP平臺于日前正式發(fā)布。
宋樂介紹,上面所說的只是AIGP平臺的功能之一,其還可以根據(jù)形狀及理化性質需求,生成一系列滿足需求的蛋白質;再就是根據(jù)一個蛋白質靶點生成對應的和靶點結合的蛋白質,比如可以針對新冠病毒生成一個蛋白質,甚至可以針對石油相關的分子生成一個酶。
據(jù)了解,過去兩年多,百圖生科構建了生命科學領域千億參數(shù)的跨模態(tài)大模型“xTrimo”。該大模型從跨物種、跨模態(tài)的生命信息中學習蛋白質如何構成和實現(xiàn)功能、如何相互作用、如何組合和調(diào)控細胞功能的關鍵規(guī)律,從而破解生命的自然語言——蛋白質。基于大模型,AI在一系列任務算法上取得了明顯的進展,除了能更好地完成結構預測等基礎任務外,也開始可以根據(jù)不同的問題,設計新的蛋白質,回答各種生命科學問題。
目前,AIGP平臺設置了3類功能模塊,分別是F2P(根據(jù)結構、功能、可開發(fā)性等功能指標設計/優(yōu)化蛋白質)、P2P(給定抗原等目標蛋白質,設計與之以特定方式結合的抗體等蛋白質),以及C2P(給定細胞,發(fā)現(xiàn)調(diào)控細胞功能的靶點蛋白質并設計相應的調(diào)控蛋白質)。
此前,AIGP平臺已經(jīng)進行了一段時間的內(nèi)部測試,在創(chuàng)新免疫調(diào)控藥物ImmuBot的研發(fā)中,貢獻了多個高性能彈頭、新功能傳感器的研發(fā)案例。
中國科學院院士、著名免疫學家董晨教授認為,AI之所以能夠解決問題,就是通過對大數(shù)據(jù)的分析和進一步的演繹與應用。
宋樂也表示,當前,根據(jù)不同模塊的輸入和要求,AIGP平臺可在較短時間內(nèi)設計和生成具有特定性質的蛋白質。今年6月起,其部分功能模塊將進一步開放,讓專業(yè)用戶可以直接自主使用,在更多的研究場景調(diào)用AI的蛋白質生成能力,激發(fā)更多的生命科學探索。
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