暹羅斗魚是風(fēng)靡全球的一種小型觀賞魚，最早在1000年前左右被人類馴化。長期以來，暹羅斗魚都因其多種多樣的體色、體型而備受人們的關(guān)注。

　　南昌大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院洪一江教授團隊主要圍繞暹羅斗魚展開研究，開展群體遺傳學(xué)與全基因組關(guān)聯(lián)分析，很大程度上闡明了暹羅斗魚復(fù)雜的馴化歷史和表型多樣性的遺傳基礎(chǔ)。

　　近日，相關(guān)研究論文發(fā)表在刊物《科學(xué)進展》上。

　　構(gòu)建高質(zhì)量染色體水平基因組

　　作為一種小型觀賞魚，暹羅斗魚擁有眾多的表型性狀。何種類型的分子突變，作用在哪些基因上從而導(dǎo)致暹羅斗魚形成這些表型性狀？這一過程的分子調(diào)控機制是什么？

　　要研究決定暹羅斗魚表型的基因，首先必須要有高質(zhì)量的參考基因組。研究團隊是如何對斗魚的基因進行測序的？

　　據(jù)悉，洪一江及其團隊采用了多種測序策略與輔助組裝工作，構(gòu)建了暹羅斗魚高質(zhì)量染色體水平基因組，最終組裝的基因組大小達451.29Mb。

　　在獲得暹羅斗魚高質(zhì)量的參考基因組之后，團隊青年教師張萬昌與泰國研究人員合作，收集了700多條代表不同表型的個體，提取了每一條魚的DNA，并利用Illumina平臺開展重測序工作，獲得了每個個體的大量測序結(jié)果。

　　這些測序結(jié)果都被定位到了暹羅斗魚的參考基因組上，通過對700多個個體的測算，獲得了總共約2000萬個變異位點。

　　為篩選相關(guān)靶點藥物提供良好研究模型

　　“我們對暹羅斗魚的研究為進一步挖掘相關(guān)功能基因提供了天然的研究模型，在遺傳學(xué)、基因組學(xué)、發(fā)育生物學(xué)和神經(jīng)生物學(xué)等學(xué)科領(lǐng)域均具有一定的價值?！焙橐唤硎?，“暹羅斗魚經(jīng)過歷史上多年以來的馴化和選育，已經(jīng)形成了諸多種類的表型變異。”暹羅斗魚豐富而多樣的品種，為研究脊椎動物形態(tài)學(xué)發(fā)生提供了天然的研究材料。

　　暹羅斗魚基因組大小在各種常見物種中較小，約為斑馬魚的1/4、小鼠的1/7。暹羅斗魚較小的基因組，使得暹羅斗魚成為了一種較為理想的研究物種。相對于其他研究物種，其遺傳學(xué)研究和分子克隆的相關(guān)成本都比較低。

　　此外，暹羅斗魚最顯著的特征就是善于進行打斗。暹羅斗魚的打斗通常包含了前期恐嚇、相互接近、奮力搏斗和落敗一方逃離等具體過程。由于打斗的復(fù)雜性，對打斗這一行為的研究涉及遺傳學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、內(nèi)分泌學(xué)、組織生理學(xué)等多學(xué)科的許多復(fù)雜性狀。

　　“從我們的初步研究結(jié)果來看，在專門用于打斗的搏擊斗魚中，某些涉及神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)控的基因受到了強烈的選擇?！焙橐唤硎荆拔覀冞€發(fā)現(xiàn)，部分受選擇的基因在小鼠和人類研究中和精神疾病如精神分裂癥、雙向性格障礙、易怒等疾病密切相關(guān)。這為將來研究這些疾病，并進一步篩選相關(guān)靶點藥物提供了很好的研究模型?！保ㄎ阂莱浚?/p>